Подготовка специалистов ВМС с высшим образованием осуществляется по 6 специальностям:

со сроком обучения 5 лет:

• 8.090781 Радиоэлектронные комплексы, системы и средства вооружения и военной техники

• 7.091481 Компьютеризованные комплексы и системы вооружения и техники войск (сил)

• 7.100302 Эксплуатация судовых энергетических установок

• 7.100381 Кораблевождение военных надводных кораблей и подводных лодок

со сроком обучения 2 года:

• 8.000085 Боевое применение и управление действиями частей Военно-морских Сил

• 8.000086 Организация боевого применения, эксплуатации и ремонта кораблей, техники и вооружения Военно-морских Сил.